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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Hortaliças. |
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Data corrente: |
11/01/2022 |
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Data da última atualização: |
11/01/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CUNHA, C. P. da; RESENDE, F. V.; ZUCCHI, M. I.; PINHEIRO, J. B. |
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Afiliação: |
CAMILA PINTO DA CUNHA, UNICAMP; FRANCISCO VILELA RESENDE, CNPH; MARIA IMACULADA ZUCCHI, UNICAMP; JOSE BALDIN PINHEIRO, APTA. |
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Título: |
SSR-based genetic diversity and structure of garlic accessions from Brazil. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetica, v. 142, n. 5, p. 419-431, 2014. |
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DOI: |
10.1007/s10709-014-9786-1 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Garlic is a spice and a medicinal plant; hence, there is an increasing interest in ?developing? new varieties with different culinary properties or with high content of nutraceutical compounds. Phenotypic traits and dominant molecular markers are predominantly used to evaluate the genetic diversity of garlic clones. However, 24 SSR markers (codominant) specific for garlic are available in the literature, fostering germplasm researches. In this study, we genotyped 130 garlic accessions from Brazil and abroad using 17 polymorphic SSR markers to assess the genetic diversity and structure. This is the first attempt to evaluate a large set of accessions maintained by Brazilian institutions. A high level of edundancy was detected in the collection (50 % of the accessions represented eight haplotypes). However, non-redundant accessions presented high genetic diversity. We detected on average five alleles per locus, Shannon index of 1.2, HO of 0.5, and HE of 0.6. A core collection was set with 17 accessions, covering 100 % of the alleles with minimum redundancy. Overall FST and D values indicate a strong genetic structure within accessions. Two major groups identified by both model-based (Bayesian approach) and hierarchical clustering (UPGMA dendrogram) techniques were coherent with the classification of accessions according to maturity time (growth cycle): early-late and midseason accessions. Assessing genetic diversity and structure of garlic collections is the first step towards an efficient management and conservation of accessions in genebanks, as well as to advance future genetic studies and improvement of garlic worldwide. MenosGarlic is a spice and a medicinal plant; hence, there is an increasing interest in ?developing? new varieties with different culinary properties or with high content of nutraceutical compounds. Phenotypic traits and dominant molecular markers are predominantly used to evaluate the genetic diversity of garlic clones. However, 24 SSR markers (codominant) specific for garlic are available in the literature, fostering germplasm researches. In this study, we genotyped 130 garlic accessions from Brazil and abroad using 17 polymorphic SSR markers to assess the genetic diversity and structure. This is the first attempt to evaluate a large set of accessions maintained by Brazilian institutions. A high level of edundancy was detected in the collection (50 % of the accessions represented eight haplotypes). However, non-redundant accessions presented high genetic diversity. We detected on average five alleles per locus, Shannon index of 1.2, HO of 0.5, and HE of 0.6. A core collection was set with 17 accessions, covering 100 % of the alleles with minimum redundancy. Overall FST and D values indicate a strong genetic structure within accessions. Two major groups identified by both model-based (Bayesian approach) and hierarchical clustering (UPGMA dendrogram) techniques were coherent with the classification of accessions according to maturity time (growth cycle): early-late and midseason accessions. Assessing genetic diversity and structure of garlic collections is the first step towards ... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Alho; Allium Sativum; Germoplasma; Marcador Molecular. |
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Thesaurus Nal: |
Cluster analysis; Genetic resources; Microsatellite repeats. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02375naa a2200253 a 4500
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520 $aGarlic is a spice and a medicinal plant; hence, there is an increasing interest in ?developing? new varieties with different culinary properties or with high content of nutraceutical compounds. Phenotypic traits and dominant molecular markers are predominantly used to evaluate the genetic diversity of garlic clones. However, 24 SSR markers (codominant) specific for garlic are available in the literature, fostering germplasm researches. In this study, we genotyped 130 garlic accessions from Brazil and abroad using 17 polymorphic SSR markers to assess the genetic diversity and structure. This is the first attempt to evaluate a large set of accessions maintained by Brazilian institutions. A high level of edundancy was detected in the collection (50 % of the accessions represented eight haplotypes). However, non-redundant accessions presented high genetic diversity. We detected on average five alleles per locus, Shannon index of 1.2, HO of 0.5, and HE of 0.6. A core collection was set with 17 accessions, covering 100 % of the alleles with minimum redundancy. Overall FST and D values indicate a strong genetic structure within accessions. Two major groups identified by both model-based (Bayesian approach) and hierarchical clustering (UPGMA dendrogram) techniques were coherent with the classification of accessions according to maturity time (growth cycle): early-late and midseason accessions. Assessing genetic diversity and structure of garlic collections is the first step towards an efficient management and conservation of accessions in genebanks, as well as to advance future genetic studies and improvement of garlic worldwide.
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Registro original: |
Embrapa Hortaliças (CNPH) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 573 | |
| 162. |  | POMARI, A. F.; BORTOLOTTO, O. C.; BUENO, A. de F.; BARBOSA, G. C. Liberação de Trichogramma pretiosum no manejo de lepidópterospraga da soja. In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 13., 2013, Bonito, MS. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2013. 1 CD-ROM. SICONBIOL.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 164. | | LUSKI, P. G. G.; QUEIROZ, A. P.; BUENO, A. de F.; NEVES, P. M. O. J. Eficiência de Spodoptera frugiperda multiple nucleopolyhedrovirus (SfMNPV) associado com herbicidas no milho e soja em campo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 27.; CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE ENTOMOLOGIA, 10., 2018, Gramado, RS. Saúde, ambiente e agricultura: anais. Santo Antonio de Goiás: SEB: UFSM, 2018. v. 2. resumo. p. 1620.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 165. | | MACRI, T. H. M.; HAYASHIDA, R.; SILVA, D. M. da; BUENO, A. de F. Injúrias causadas pela broca-das-axilas Crocidosema aporema (Lepidoptera: Tortricidae) em soja Bt. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 9., 2022, Foz do iguaçu, PR. Desafios para a produtividade sustentável no Mercosul: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2022. Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, Adeney de Freitas Bueno, editores técnicos. resumo 82. p. 100.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 167. | | QUEIROZ, A. P.; BUENO, A. de F.; NEIVA, M. M.; FAVETTI, B. M. Interação competitiva entre Telenomus podisi e Trissolcus urichi em ovos de Dichelops melacanthus. In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 16., 2019, Londrina. Controle biológico: da academia ao campo, rumo à sustentabilidade: anais. Londrina: Sociedade Entomológica do Brasil: Embrapa Soja: Universidade Estadual de Londrina, 2019. 495 p. Organizadores: Adeney de Freitas Bueno, Pedro Manuel Oliveira Janeiro, Michele Potrich, Geraldo Andrade Carvalho. p. 183.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 168. | | BORTOLOTTO, O. C.; SILVA, G. V.; BUENO, A. de F.; RODRIGUES, R. B.; QUEIROZ, A. P. The influence of Bt-maize on biological traits of Spodoptera eridania (Cramer, 1782) and Spodoptera frugiperda (Smith, 1789) (Lepidoptera: Noctuidae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 25., 2014, Goiânia. Entomologia integrada à sociedade para o desenvolvimento sustentável: anais. [Londrina]: SEB, 2014. não paginado| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 169. | | DAIKOHARA, C. S.; RODRIGUES, A. R.; BUENO, A. de F.; SEIXAS, C. D. S. Identificação de díptero predador de esporos de Phakopsora pachyrhizi (ferrugem-asiática da soja). In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 17., 2022, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2022. (Embrapa Soja. Documentos, 446). Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, Larissa Alexandra Cardoso Moraes, Kelly Catharin, Editoras Técnicas. p. 55-61.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 170. | | BARBOSA, G. C.; FRUGERI, A. P.; BORTOLOTTO, O. C.; SILVA, G. V.; BUENO, A. F. Impacto de diferentes níveis de injúrias sobre a produtividade de cultivares de soja de hábito de crescimento determinado e indeterminado. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 7., 2012, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2012. p. 62-67. (Embrapa Soja. Documentos, 333). Editado por Paula Gerón Saiz de Mello. Disponível em: .| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 173. | | BUENO, A. de F.; COLMENAREZ, Y. C.; MACIEL, R. M. A. The importance of biological control in the management of Helicoverpa Armigera in Brazil: The example of soybean. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON BIOLOGICAL CONTROL OF ARTHROPODS - ISBCA, 6., 2022, British Columbia. Proceedings... [S. l.]: IOBC, 2022. Donald C. Weber, Tara D. Gariepy, William R. Morrison III, editores. p. 119-121.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 175. | | QUEIROZ, A. P.; TAGUTI, E. A.; BUENO, A. F.; GRANDE, M. L. M.; COSTA, C. O. Host preferences of Telenomus podisi (Hymenoptera: Scelionidae): parasitism on eggs of Dichelops melacanthus,Euschistus heros, and Podisus nigrispinus (Hemiptera: Pentatomidae). Neotropical entomology, v. 47, p. 543-552, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 176. | | QUEIROZ, A. P.; POMARI, A. F.; BUENO, A. de F.; BORTOLI, S. A. de. Importância da umidade relativa para o parasitismo de Telenomus remus em ovos Spodoptera frugiperda e Corcyra cephalonica. In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 13., 2013, Bonito, MS. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2013. 1 CD-ROM. SICONBIOL.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 178. | | QUEIROZ, A. P.; POMARI, A. F.; BUENO, A. de F.; BORTOLI, S. A. de. Influência da umidade relativa nas características biológicas deTelenomus remus em ovos Spodoptera frugiperda e Corcyra cephalonica. In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 13., 2013, Bonito, MS. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2013. 1 CD-ROM. SICONBIOL.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 179. | | BUENO, A. R.; ALENCAR, M. M. de; COSTA, M. J. R. P.; NEGRÃO, J. A. Influência do sexo, sistema de produção e temperamento no ganho em peso de bezerros puros e cruzados Nelores na fase da desmama. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 40., 2003, Santa Maria, RS. Anais... Santa Maria: SBZ, 2003. 1 CD-ROM. 5f.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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